三国、两晋、南北朝时期重要的本草著作除《吴普本草》（年）、《李当之药录》（年）、《名医别录》（年）外，首推南朝梁代陶弘景（—年）所辑《本草经集注》。
该书约成书于5世纪末，全书7卷，载药种。其在“序例”部分，对《神农本草经》原文逐一加以注释，并增补了大量有关药物采收时节、产地、品种鉴别、加工炮制方法，古今药用度量衡折合，丸散汤酒膏的制法要点及合药注意事项，诸病通用药，中*解救法，服药食忌例，凡药不宜入汤酒者，药物畏恶七情等内容。
在单味药的分类上，该书首创了按药物自然属性分类的方法，同时也保留了《神农本草经》的上、中、下三品分类，即把药物分为玉石、草木、虫兽、果、菜、米食、有名无实七类，并在各类之中（有名无实除外）再以三品为序排列药物。
其首创的“诸病通用药”，分别列举80多种疾病的通用药物，如治风通用药有防风、防己、秦艽、川芎等，治*疸通用药有茵陈、栀子、紫草等，便于药物检索和医生临证处方用药。
在单味药的书写方法上，该书采用“朱墨杂书，并子注”，即朱书《神农本草经》，墨写《名医别录》，附经为文，双行小字加注，是《神农本草经》较早注本的一种。
它系统地总结了六朝以前的本草学成就，全面地发展了本草学基本理论。该书不仅是这一时期最具代表性的本草著作，而且标志着综合本草模式的初步确立，奠定了中国古本草的编写体例。原书早佚，其主要内容仍保存于《经史证类备急本草》等书中。此外，又有在敦煌出土的唐以前写本残卷1种，但仅存其序例部分。
